근미래 일본. 사람들의 생활양식은 지금과 크게 다를 바 없으나, 환경호르몬과 공해, 방사능 등 복합적인 요인으로 인구의 약 8할이 돌연변이, 즉 초능력을 가지고 태어나게 되었다.
이런 초능력을 ‘개성’이라 칭하며, 눈동자나 머리색의 유전처럼 자연스럽게 받아들이는 사회. 오히려 초능력이 없는 사람을 찾아보기 힘든 이 세계에서는 당연히 능력을 악용한 범죄가 급증하고, 그런 범죄자들을 처단하는 ‘정의의 사자’를 표방한 집단, ‘히어로’가 생겨난다.
초능력 범죄에 맞서 시민들의 평화를 지키는, 일종의 특수경찰로서의 임무를 수행하는 ‘히어로’ 집단의 인기는 연예인과 맞먹는다.
이에 따라, 청소년들이 가장 선호하는 장래의 꿈도 당연히 ‘히어로’. 초능력이 보편적인 이 세계에는 일급 히어로를 양성하는 국립기관까지 설립된 상황.
모든 이야기는, 어릴 때부터 ‘히어로’가 꿈이었지만 초능력을 타고나지 못해 주위에서 비웃음만 당하던 14세 소년이, 포기하지 않고 국립 히어로 학교인 유에이 고교 입학시험에 도전하면서 시작된다!!